Realizó su doctorado en el Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM y sus estudios posdoctorales en el Center for Cancer Research – National Institutes of Health (NIH), en USA. También ha sido Profesor Visitante en Wilfrid Laurier University, en Canadá. Actualmente es Profesor Investigador en la Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, México, donde desarrolla investigaciones en ciencias agrogenómicas e interacciones planta-microbioma. Ha publicado numerosos trabajos científicos, con más de 11,000 citas, incluyendo ocho libros sobre microorganismos benéficos del suelo y estrés ambiental. Sus publicaciones son de carácter multidisciplinario e incluyen estrechas colaboraciones con colegas de diversos países. Es miembro de comités editoriales de revistas de alto impacto en las áreas de microbiología y biología de plantas.

La carrera científica de Jose A Pascual, investigador científico del CSIC, ha tenido como nexo de unión el mantenimiento de la calidad del suelo, ahora denominada SALUD DE SUELO, siendo el aprovechamiento de los residuos orgánicos con el objeto de convertirlos en “recursos con valor añadido”, y es en este sentido donde he trabajado en el diseño de procesos de compostaje dirigidos; por un lado, mediante la selección de materiales de partida  específicos y adecuados para los fines buscados; como por otra, mediante el aislamiento e inoculación de microorganismos beneficiosos (biopesticidas, bioestimulantes y/o biofertilizantes).